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我国科学家用多重组学大数据解读番茄前世今生
信源:科学网|编辑:2018-01-13| 网址:http://www.popyard.org     抄送朋友打印保留

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美国时间1月11日,《细胞》(Cell)杂志2018年第一期刊登了中国农业科学院深圳农业基因组所(简称基因组所)研究员黄三文团队、华中农业大学教授罗杰团队及合作者在番茄风味品质研究中取得的重要突破,这标志着我国科学家在番茄基因组研究领域实现国际领先。

“这是科学家第一次采用基因组、转录组、代谢组等多组学大数据同时分析一种作物的育种过程,并解读三者之间相互关系。”黄三文在深圳举行的座谈会上告诉《中国科学报》记者。

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图一:果实代谢组生物网络,包含13000 多组代谢物-基因-SNP关系,涉及371中代谢物,970个信号位点,535个基因。不同颜色圆圈代表不同物质,不同三角形代表不同表达模块的基因。

这项成果在黄三文团队之前的研究基础之上,进一步揭示了番茄口味在驯化中逐步变化的遗传基础,不仅发现了控制番茄碱的多个遗传位点,而且发现了影响番茄风味的更多新物质和信号位点。研究为植物代谢物的分子机理研究提供了源头大数据和方法创新,为更为营养、美味番茄的全基因组设计育种提供了路线图。

Cell同期配发了美国科学院院士、康奈尔大学教授James

Giovannoni题为“番茄多组学揭示作物驯化和改良的影响”的评述文章,认为:“这项研究加深了对作物品质化学的科学认识,将推动高品质品种培育,最终消费者能够从风味更佳、营养更好的食品供应中得利”。据悉,《细胞》杂志两位审稿人在评语中赞叹到这是一部“力作”(tour de force)。

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